什么是宏生物
与微生物相对的海洋生物
什么是宏生物
与微生物相对的海洋生物
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什么是宏基因
在生物学里，宏基因组一般指metagenomics，是某一个研究对象中所有的基因组的总和。相对应的，是个体的基因组。举例来说，人的粪便，其中有很多种细菌，大肠杆菌、阴沟肠杆菌什么的。一份粪便样本，提取全部的DNA并研究，这就是宏基因组的思路。全部的DNA包括里边所有的细菌的，还包括排出这个粪便的个体的（人）。相对常用的概念指的是里边的全部微生物的DNA，不考虑人的。这个概念是将样本中的所有微生物看做一个整体，好处是不用分离每一种菌来研究，缺点是不知道哪个基因来自哪个菌。尤其是一些质粒片段。
宏基因组测序与高通量测序的区别
高通量测序技术是一种测序技术，16S rRNA基因测序是一种测序策略，类似的策略还有基因组、宏基因组鸟枪法测序，转录组测序，宏转录组测序等，这些测序策略是通过高通量测序技术来实现的。高通量测序技术的关键创新在于可逆终止PCR和荧光显微拍照的结合。详情如下：第二代测序原理的详细解析！16S rRNA基因也叫16S rDNA，16S rRNA基因测序是指通过PCR将微生物DNA中的16S rDNA扩增出来，由于测序读长限制一般只扩增1-2个区例如V3-V4、V4-V5区，扩增出来后通过高通量测序仪进行测序，从而获得序列信息，优点是成本低，缺点是无法获得功能基因，群落信息有限，目前优秀文章大都是宏基因组鸟枪法测序而不是16S rRNA。
宏基因组测序需要多少数据量
宏基因组一般需要测6-8G的数据量，这样才能饱和。