有问题就有答案
靶基因能做GO功能富集分析吗
最近做了芯片,找到些差异miRNA。下面想找到靶基因做功能相关的实验。但是在靶基因预测方面遇到一些问题。有两个想法:想法1:1、把某个miRNA放入TargetScan、miRDB等几个数据库中,搜索其预测靶基因;2、从这些靶基因中找出几个数据库的交集;3、把交集中的靶基因去做pathway分析,找出与我研究内容相关的信号通路。关于这个想法有几个问题:1.找到的这几个处在交集中的靶基因能做GO功能富集分析吗?2.几个不同的靶基因能同时在pathway里找吗?现在是单独输入一个靶基因去看它的通路,(是不是会有某个通路几个靶基因同时在里面呢?)想法2:1、选定某个miRNA,同时选定某个靶基因预测数据库,2、在该数据库中预测出n多靶基因,3、对这些靶基因直接进行功能富集分析;4、对这些靶基因进行pathway分析;关于这个想法也有一些迷惑的地方:GO和Pathway的结果如何综合起来?单一某个靶基因预测数据库是否略显单薄?请大家走过路过别错过,进来指教一下!
阅读资料,回答1
A、通过分析可知,光合作用的原料有二氧化碳和水,因此水是光合作用的原料之一,光合作用的另一个原料是二氧化碳,A正确;
B、有机物是光合作用的产物,不是原料,B不正确;
C、氧气是光合作用的产物,不是原料,C不正确;
D、叶绿体是光合作用的场所,不是原料,D不正确.
故选:A.
科学院、国家计委、科技部于2001年10月12日联合宣布,具有国际领先水平的超级杂交水稻(籼稻)基因组(水稻体内DNA分子所携带的全部遗传信息)“工作框架图”和数据库
解析: ( 1 ) 12 ;( 2 ) 4 ,秋水仙素;( 3 )可以用连续自交的方法,也可以用单倍体育种的方法等。最简便的是单倍体育种。如将某些植株的花药全部摘下,进行花粉组织培养,成...
如何从基因组数据库中挖掘目标基因
最简单,但是未必最有效的办法,但是最快抽个样本,把你的目标基因打上标记,然后建立一个模型,比如决策树等等模型质量不错的情况下跑全库,然后找出分类结果为你目标分类的记录