结构特征不同、作用不同。金双歧虽然和益生菌都是活性菌，而前者是双歧杆菌的其中的一个分支，益生菌包含金双歧。金双歧和益生菌作用相似，但是益生菌的作用更广泛，平时可以直接食用益生菌，但是金双歧主要是用于临床防治疾病方面。
金双歧和益生菌的区别：
1、结构特征不同
金双歧虽然和益生菌都是活性菌，而前者是双歧杆菌的其中的一个分支，益生菌的分类有很多，其中包括有三大类，第一为乳杆菌类，第二为双歧杆菌类，其中金双歧就属于这一类，还有革兰氏阳性球菌类，所以说益生菌包含金双歧。
２、作用不同
金双歧和益生菌的作用相似，但是益生菌的作用更广泛，平时可以直接食用益生菌，包括含有益生菌的保健品还有益生菌的酸奶都可以直接食用，但是金双歧主要是用于临床防治疾病方面。